Bir zamanlar, Bafa Gölü Ege Denizi'ne bağlıydı ve derin Milet Körfezi'nin en uzak kısmıydı. Bu körfez boyunca güçlü Milet şehri (körfez girişini koruyan), Priene limanı (Nulochos) ve Myus, Phyrrh, Latmos Heracleia ve Ioniapolis gibi daha küçük liman kasabaları vardı.
Ionaiapolis, Heracleia'dan önce kuruldu ve limanı bir zamanlar Miletos ve dağın adını taşıyan küçük kasaba Latmos tarafından kullanıldı. Geç Antik Çağ'dan başlayarak (5. yüzyıl civarında), Menderes Nehri'nin alüvyon yatakları, Latmos Körfezi'nin girişini yavaş yavaş sildi, böylece Orta Çağ'ın sonunda (15. yüzyıl civarında) denizle bağlantısı tamamen kesildi .